Wissenschaftler*in (PostDoc) (m/w/d) Text Mining für Biodiversitätswissen (Entomologie und historische Texte) (Vollzeit / Teilzeit)
Von Alexandra JohnDie Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung mit Hauptsitz in Frankfurt am Main sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt für das Informationszentrum Entomologie des Senckenberg Deutschen Entomologischen Instituts am Standort Müncheberg eine*n
Wissenschaftler*in (PostDoc) (m/w/d)
Text Mining für Biodiversitätswissen
(Entomologie und historische Texte)
(Vollzeit / Teilzeit)
Ort: Müncheberg (Brandenburg)
Beschäftigungsumfang: Vollzeit / Teilzeit (mindestens 50%)
Vertragsart: zunächst befristet (3 Jahre)
Vergütung: Tarifvertrag der Länder (TV-L) E13
Die Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung (SGN) wurde 1817 gegründet und zählt zu den wichtigsten Forschungseinrichtungen rund um die biologische Vielfalt. An unseren zwölf Standorten in ganz Deutschland betreiben Wissenschaftler*innen aus über 40 Nationen modernste Forschung auf internationaler Ebene. Das Senckenberg Deutsche Entomologische Institut (SDEI) in Müncheberg (Brandenburg) beherbergt eine der größten Insektensammlungen Deutschlands. Gegründet 1886 betreibt das Institut Grundlagenforschung in Taxonomie, Phylogenie, Ökologie und Biogeographie, um die Vielfalt der Insekten zu dokumentieren und zu verstehen. Das SDEI ist in zwei Abteilungen gegliedert: Das Informationszentrum Entomologie betreut die entomologische Spezialbibliothek, ein Archiv und mehrere entomologische Informationsdienste und ermöglicht den Zugang zu entomologischer Literatur und Daten. Das Institut ist auf dem Campus des Leibniz-Zentrums für Agrarlandschaftsforschung (ZALF) in Müncheberg bei Berlin angesiedelt und in regionale, nationale und internationale (Biodiversitäts-)Forschungsnetzwerke eingebunden.
Ihre Aufgaben
• Entwicklung und Anwendung von Methoden zur Extraktion biodiversitätsrelevanter
Informationen (z. B. Taxa, Sammler*innen, Fundorte) aus historischen Textquellen
wie Artenbeschreibungen, Etiketten, Typenkatalogen, Archivalien sowie
taxonomischer und faunistischer Literatur
• Konzeption und Erprobung von Werkzeugen zur Identifizierung und Verknüpfung
zentraler Entitäten (z. B. Artnamen, Personen, Orte), einschließlich Disambiguierung
und semantischer Anreicherung in biodiversitäts- und entomologischen Kontexten
• Aufbau und Optimierung von Workflows zur Analyse biodiversitätsrelevanter und
entomologische Texte mit Fokus auf funktionale Merkmale (traits), historische
Kontexte und geographische Verbreitung in Bezug auf aktuelle Umweltfragen
• Integration der gewonnenen Informationen in Biodiversitätsdateninfrastrukturen (z.
B. DiSSCo, GBIF, Disentis Libroscope) unter Beachtung der FAIR-Prinzipien und
gängiger Datenstandards (z. B. RDF, Darwin Core)
• Zusammenarbeit mit Fachleuten aus Biodiversitätsforschung, Taxonomie und
Sammlung am SDEI und bei Senckenberg zur Abstimmung der Text-Mining-Ansätze
mit Digitalisierungsstrategien, Sammlungsentwicklung und Datenmobilisierung
• Entwicklung von Ansätzen und Methoden für eine inklusive Wissensextraktion unter
Berücksichtigung von Taxa aus dem Globalen Süden, multilingualen Quellen sowie
der Beiträge historisch unterrepräsentierter Personengruppen (z. B. Frauen,
marginalisierte Akteur*innen, lokale oder indigene Sammler*innen)
• Förderung von Open Science und Community Engagement durch Veröffentlichung
der entwickelten Werkzeuge und Datensätze, Unterstützung von Trainings und
Workshops sowie Mitwirkung an Standards in der Biodiversitätstextanalyse
• Veröffentlichung von Forschungsergebnissen in peer-review Fachzeitschriften,
Präsentationen auf wissenschaftlichen Konferenzen und Mitwirkung an kooperativen
Forschungsanträgen
Ihr Profil
• Abgeschlossenes Masterstudium in Biodiversitätsinformatik, Geoinformatik,
Datenwissenschaften (Natural Language Processing), Computerlinguistik,
Taxonomie (vorzugsweise Entomologie) oder Ökologie mit ausgeprägten
Datenkompetenzen
• Erfahrung im Text Mining wissenschaftlicher und historischer Dokumente,
einschließlich OCR-Nachbearbeitung und Parsen von historischen Texten
• Kenntnisse in wissenschaftlicher Programmierung (bevorzugt Python),
Versionskontrolle (z. B. Git) sowie in Datenstandards wie RDF und Darwin Core
• Erfahrung im Bereich Named Entity Recognition, semantischer Annotation und
Verknüpfung mit externen Ressourcen, z. B. Wikidata, GBIF, GeoNames, ORCID
• Publikationsleistungen entsprechend der Karrierestufe
• Erfahrung in der Mitwirkung an oder Einwerbung von Drittmittelprojekten, dem
Erfahrungsstand entsprechend
• Ausgeprägte analytische Fähigkeiten; eigenständiges wie auch kooperatives
Arbeiten in einem interdisziplinären Umfeld
• Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift; Bereitschaft zum Erwerb von
Deutschkenntnissen wird erwartet und unterstützt
Wünschenswert
• Abgeschlossenes Promotionsstudium in einem der oben genannten Fächer
• Erfahrung im Bereich der internationalen und interdisziplinären Zusammenarbeit mit
Forschenden, Kurator*innen und Teams von Dateninfrastrukturen
• Kenntnisse in Taxonomie oder Systematik (vorzugsweise Entomologie) sowie im
Umgang mit Biodiversitätsliteratur
• Erfahrung mit der Nutzung von Biodiversitätsdateninfrastrukturen (z. B. GBIF,
DiSSCo) und Engagement für FAIR- und Open-Science-Praktiken
• Vorerfahrung im Bereich der Arbeit mit historischen und multilingualen
Biodiversitätstexten (z. B. Deutsch, Französisch, Latein, Russisch)
Wir bieten
• eine attraktive Tätigkeit im dynamischen Arbeitsumfeld einer weltweit anerkannten
Forschungseinrichtung mit der Möglichkeit, das Forschungsprofil der Abteilung
Informationszentrum Entomologie am SDEI aktiv mitzugestalten
• Gelegenheit zum Aufbau eines eigenständigen wissenschaftlichen Profils im
Bereich Biodiversitätstextmining und – analyse
• Zugang zu einem internationalen Netzwerk von Wissenschaftlern, politischen
Entscheidungsträgern und Forschungsorganisationen mit engen Verbindungen zu
Initiativen wie DiSSCo und der Disentis Roadmap sowie zu Expert*innennetzwerken
wie CETAF und TDWG
• flexible Arbeitszeiten – mobiles Arbeiten – eine tarifliche Jahressonderzahlung –
tariflichen Urlaubsanspruch – betriebliche Altersvorsorge (ZVK)
Senckenberg engagiert sich für Vielfalt. Wir profitieren von den unterschiedlichen Expertisen, Perspektiven und Persönlichkeiten unserer Mitarbeiter*innen und freuen uns über jede Bewerbung qualifizierter Kandidat*innen, unabhängig von Alter, Geschlecht oder geschlechtlicher Identität, ethnischer oder kultureller Herkunft, Religion und Weltanschauung, sexueller Orientierung und Identität oder Behinderung. Frauen sind besonders aufgefordert, sich zu bewerben, da sie im Bereich dieser Position unterrepräsentiert sind; bei gleicher Qualifikation und Eignung werden sie bevorzugt eingestellt. Bewerber*innen mit einer Schwerbehinderung werden bei gleicher Eignung besonders berücksichtigt. Senckenberg unterstützt aktiv die Vereinbarkeit von Beruf und Familie und legt großen Wert auf eine gleichberechtigte und inklusive Kultur der Zusammenarbeit.
Sie möchten sich bewerben?
Dann senden Sie uns Ihre vollständigen und aussagekräftigen Bewerbungsunterlagen (Motivationsschreiben mit kurzer Beschreibung der bereits abgeschlossenen und aktuellen Forschung, Lebenslauf, akademische Zeugnisse, Publikationsliste und, falls vorhanden, Empfehlungsschreiben) in elektronischer Form (als zusammenhängende PDF-Datei) bitte stets unter Angabe der Referenznummer #09-25003 bis zum 17.10.2025 an recruiting@senckenberg.de oder bewerben Sie sich direkt auf unserer Homepage über das Online-Bewerbungsformular www.senckenberg.de/de/karriere/bewerbung/.
Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung
Senckenberganlage 25
60325 Frankfurt a.M.
E-Mail: recruiting@senckenberg.de
Für fachliche Rückfragen zur Stelle steht Ihnen Frau Dr. Jana Hoffmann unter
jana.hoffmann@senckenberg.de sehr gerne zur Verfügung.
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